hdbファイルを保存した後、教えられた手順を実行してみました。

> □DX局のコールサインは、/ を含めてデュプチェックするにチェックを入れて変換実行。
> □DX局のコールサインは、/ を含めてデュプチェックするにチェックを外して変換実行。
> https://hamlog.sakura.ne.jp/html/HID00035.html
> これでどうなりますか？

残念ですが、状況は変わらず、今までと同じでした。

過去にQSOした　SV2/SQ9UM　は、JT_Linker経由でハムログに入力したものです。
浜田さんが言われたように、このSV2部分をコールサインの先頭文字と解釈しているようです。

どの部分がコールサインかどうかの情報は、hdbファイルの中にあるのでしょうか。
別のパソコンにhdbファイルを入れて実験してみようと思います。
また報告します。