中岡さん、こんばんは。アドバイス有難うございます。
以下の設定は一番最初に確認しました。どの設定をしてもUTCで登録され環境設定が壊れていると勘違いをしました。

> ＨＡＭＬＯＧの入力環境設定の
> □ DX局はUTC
> ここを黒チェックしておくと、コールサイン欄のDXにチェックが入っている場合、時間がUTC（日本時間より９時間遅い）で入力されます。
> ここに淡色チェックマークを付けた場合は、国内QSOもDX-QSOも、すべて時間がUTCで入力されます。
> チェックマークが無い場合は、すべてJSTです。
> 此処は関係ないですか？。

先ほどの菅野さんの返事にも書きましたが、JT_Linkerの設定を私が変えてしまったようです。JT_Linkerの設定を菅野さんのご指摘通り変更しやっと解決できました。
中岡さんにもご心配いただき有難う御座いました。お二人のアドバイスで解決できました。