そのcsvファイルはどうやって作りましたか?複合条件検索と印刷で作りましたか?であれば0が抜けたりしないはずです。作ったcsvファイルをエクセルで開いて上書き保存などしませんでしたか?これをやると、ご指摘のようにデータをぶっ壊します。エクセルは使ってはいけません。