> ジブラルタルに、「ZB2RR」と、「ZB2R」という別々の局がいます。「ZB2RR」はLoTWに対応してくれますが、「ZB2R」のQSL入手はダイレクトで送っていただく必要があります。そこで「ZB2R」で検索し3BAND分のデータを1枚のカードに印刷したところ、「ZB2RR」が印刷されてしまいました。1データを1枚のカードに印刷しても「ZB2RR」が印刷されます。バージョンは5.39aです。

ここの検索は
指定文字列を含む　データの検索に成っているようですよ。

天野さんの場合　Ver5.39aですから　「選択して印刷」　と言うチェックボックス　が　閉じるボタンの上近辺にあると思います。これにチェックを入れておいて開始ボタンを押すと、印刷前に印刷予定のデータ一覧が出ますので。ここで「ZB2RR」のデータのチェックを外してやれば　「ZB2R」のみの印刷が出来ると思います。
このほかに　LoTW 対象局「ZB2RR」には　QSL欄２桁目にL等の記号を入れておき、更に印刷ウィンドウ　上２行目にある　「未発行局を印刷」にチェックを入れておけば　「ZB2RR」は対象外にも出来ます。