>４〜５局くらい終わると、コールサインのアルファベットが勝手にひらがな入力
>に代わってしまいます。

多分ですが、　
Windows 8 以降、IME Mode の切り替えは、ユーザー単位で切り替わるようになった為、アプリから IME Mode 制御が出来ないようになりました。
と言う事です。すなわち、従来はアプリ単位で　IME Modeを指定するとその設定に従って動作していましたが現在は動きません。OSの仕様が変わった様です。
対応方法は　Windowsの設定　地域と言語　言語　のキーボード　にアプリウインドウごとに異なる入力方式を設定する　を設定してみて下さい。
それでうまく行くかどうかは　分かりませんが。

> 太田さんお世話になります。ＱＳＬ未着コール順一覧で確認すると約５０００件出て
> きますのでやりずらいです。
> できればQSL受領マークでやりたいです。(やりやすい)
使い方の問題でしょう　３文字打てば候補が出てくるし　inset キー　を押せば受領処理は終わり。編集ウィンドウも簡単に起動出来るので個別の編集も可能です。
どちらにしても　IME Mode の問題は同じですから　使いやすい方法でお使い下さい。