> リグとの接続運用中に入力のUSBを誤って外した場合に、再接続をしても読み込みが出来ません。ハムログを再起動をさせれば接続できますが、再接続での取り込みが出来る方法はどうすればいいのでしょうか。

USBを外すし、再挿入すると、新たにシリアルポートが割り付けられますので、その番号を変更するか、Hamjogの設定を新しいポートに変更するかと言う事になります。
前者であれば　Winのバージョンに対応した変更方法を　調べて下さい。後者であれば、
https://hamlog.sakura.ne.jp/html/HID00109.html
等を参考に設定してください。こちらが良いと思いますよ。