仮想ＣＯＭポートドライバーは正常と思います。

> このセットでCOMボタン」を押すと、「(No.2)何らかの原因で使えません」となります。
以前にもこのような事象がありましたが、
確かこのメッセージは無視してよかった？かと。

> 以前、FTDX3000で接続できていたUSBポートですが、青色のUSB3.0のようです。
お使いのＰＣによりますが、BIOSで3.0と2.0を切り替えて使用できる物や、
ＰＣ側で判断して切り替える物があります。お使いのＰＣのマニュアルを
読んでみて下さい。
恐らく、ＰＣ側でネゴシエーション時に自動的に切り替えているものと思います。

ネットで検索するといくつか設定例が見つかると思います。
ＣＯＭスピードは、設定値で正常であったり異常だったりする様子です。
最近の新しいＰＣでしたら３８４００ｂｐｓにするとよいかも？です。

ここのサイトを見てください（ご参考）。
これはＦＴ−９９１Ａですから、ＦＴ−９９１でしたらタイマーコマンドは［１］かも？。
https://ji3csh.air-nifty.com/blog/2019/12/post-11dcfe.html
その他
https://ja7fkf.at.webry.info/201711/article_1.html

確か肝は使用するＬＯＧ入力フォームの、入力環境設定の「リグ接続設定」で、
KENWOOD-1を選択し、FT-2000/9000にチェックを入れる？だったかと。
このFT-2000/9000のチェックは2段階になっているので注意してください。
レ点の色でＶＦＯを指定しています。

間違っていたらごめんなさい。
尚、この事象は過去にもありますから、［ワード検索］すると見つかると思います。