> リグとの接続は出来ており、周波数もモードも正しく動いてます。
> 何か音声のための設定が必要でしょうか？

変調信号がリグに入力されていないと推測します。
その場合に、下記２点を明確にされてください。

１、PTT制御：CQマシーン機能を使用の場合はそのまま、またはDTR/RTSを使用しているか。

２，PCの出力デバイス：WAV音声はPCのどの出力デバイスで出力していますでしょうか。
USB経由なのか、PCのAudio出力を利用かで、リグのSSB入力をメニューで指定ください。ここが重要です。
USB経由の場合は、PCのAudio(スピーカー出力デバイス）出力をそのデバイスに設定必要です。
例えばPC-リグの音声接続が(3-USB Audio CODEC)を利用の場合は、スピーカー(3-USB Audio CODEC)に指定する。

設定
・PTT制御：CQマシーンの機能をそのまま
・リグのFT-991Aメニューモードで
-------------------------USB経由------DATA/MICを利用
#106 SSB MIC SELECT-------REAR--------(DATA)/MIC
#108 SSB PTT SELECT-------DAKY--------DAKY。RTS/DTRはPTT制御をUSB使用時です
　　　　　　　　　　　　　　なお、RTS/DTRの場合は、全面マイク入力信号が無効になるため注意が必要です。
#109 PORT SELECT----------USB---------DATA/(MIC)